围绕国家南海主权、安全和发展利益，开展法律和政策研究，包括南海领土主权与海洋权益争端解决、危机管控、规则秩序构建理论与实证，南海法理、舆论引导和国际话语权斗争，外国涉海立法与国家实践，国际海洋治理法律、政策与实践等研究。

充分利用历史文献，开展南海历史文化研究，包括我国南海诸岛主权归属和海洋权益、历史性权利、断续线、更路簿等研究。建设南海诸岛民国档案资料库、更路薄历史资料库、专业图书馆，夯实南海维权历史和法理证据链。协助《南海学刊》约稿、审稿、编辑及出版等工作。

围绕南海域内外国家的政治、经济、文化、外交、军事等领域，开展区域国别研究，构建服务国家总体外交的国别和区域研究网络体系。

开展“一带一路”倡议及南海区域合作，国家海洋安全战略，周边国家中长期海洋发展战略和规划，南海域内外国家在亚太地区军力部署，海南建设国家重大战略服务保障区等研究。

立足国家亟需和智库特色，开展公共外交研究。开展海南全面深化改革开放重大问题，以及南海资源开发、气候变化、海洋生态环境资源等多学科交叉性研究。

拟定本单位国内外学术交流与合作的发展规划。负责国内外学术来访和学术出访活动策划及实施，承办各类国内外学术会议。拓展与国内外智库、政府团体、国际组织和高校的合作项目。组织实施涉海培训项目。为服务海南涉海、涉外工作提供支撑保障。

负责机关日常运转，承担文秘、会务、机要保密、组织人事、财务资产、档案管理、后勤保障、信息化建设等工作。统筹本单位国家高端智库建设和科研管理工作。
机关党委
负责本单位党的建设和纪检工作，领导群团组织工作。