中国南海研究院院长吴士存接受《旺报》专访时表示，台湾应该多在南海议题上发出自己的声音，不要受到美国的压力，且台湾在南海立场上只关注太平岛是不够的，也应该拿出台湾当局所主张的「南海十一段线」来向菲律宾等国据理力争，共同维护中华民族在南海的利益。

吴士存表示，自2013年菲律宾提交南海仲裁案以来，台湾无论是官方还是民间，都一直保持沉默，直至今年7月7日才发布了《中华民国对南海问题之立场声明》。但从陆方的观点来看，台湾的立场声明并不是完全到位，整个南沙群岛的主权，台湾却只针对太平岛发表声明，应该拿出台湾当局所主张的「南海十一段线」来维护切身利益。

吴士存认为，台湾之所以选择不对整个南海主权发声，美国因素是台湾的最大顾虑。美国在背后告诫台湾，南海问题不能和大陆秉持同一立场，但美国告诫的同时，却也完全没从台湾本身利益的角度来考虑。台湾人民应该去思考，美国在南海议题上影响菲律宾颇深，但菲律宾在南海仲裁案的诉求中，却损及台湾南海利益，美国如果真关心、保护台湾，就不会默许菲律宾这么做；而美国既然不愿维护台湾利益，台湾在南海问题上为何又要听美国的？

吴士存指出，荷兰常设仲裁庭，对菲律宾南海仲裁案的初步判决结果，近期就将出炉，如果仲裁庭在此次判决中认为菲律宾对仲裁案具有管辖权，就意谓着此案进入实体审议阶段。而菲律宾提交的诉状中有14项诉求，第一项就是中国大陆主张的九段线不符合《海洋法公约》，要求中国放弃U形线主张；而诉求中最影响台湾的，则是菲律宾主张太平岛只是个岩礁、不是岛，不具备拥有200海里专属经济区的权力。

吴士存强调，此案同时影响到两岸在南海的权益，这也是为何两岸选定在近期，共同在台湾举办国际级会议，以共同研究两岸如何应对菲律宾南海仲裁案的主要原因。