2016年3月25日，由我院牵头发起，印尼战略与国际问题研究中心等一批在东南亚有影响力的智库机构共同参与的中国－东南亚南海研究中心（China-Southeast Asia Research Center on the South China Sea, CSARC）正式宣布挂牌成立。吴士存院长与印尼战略与国际问题研究中心执行董事瓦南迪共同为研究中心揭牌。外交部副部长刘振民、海南省委副书记李军等出席了揭牌仪式。

刘振民副部长对研究中心的成立表示热烈祝贺，表示期待地区国家涉海研究智库间大力增进交流和合作。李军副书记指出，智库交流与合作对促进南海和平稳定，推动本地区国家共同应对挑战具有特殊而重要的作用。

中国－东南亚南海研究中心是立足国内、面向东南亚、辐射全球的南海问题交流平台，也是地区国家涉海研究合作的新范式。该研究中心将广泛聘请国内外知名南海问题专家担任研究员，并通过经常性召开国际研讨会、学者访问交流等形式深化国内外涉南海研究机构的联系，放大和平理性声音，传递地区国家维护南海和平稳定的共同心声。